Ашказаны асты бизе яман шеше - дөньядагы иң үлемгә китерә торган шешләрнең берсе, аның фаразы начар. Шуңа күрә, ашказаны асты бизе яман шеше куркынычы югары булган пациентларны ачыклау һәм дәвалауны яхшырту өчен төгәл фаразлау моделе кирәк.
Без UCSC Xena мәгълүмат базасыннан Рак Геномы Атласы (TCGA) ашказаны асты бизе аденокарциномасы (PAAD) РНКсы мәгълүматларын алдык, корреляция анализы ярдәмендә иммун белән бәйле lncRNAларны (irlncRNA) ачыкладык һәм TCGA һәм нормаль ашказаны асты бизе аденокарциномасы тукымалары арасындагы аермаларны ачыкладык. DEirlncRNA) TCGA һәм ашказаны асты бизе тукымасының генотип тукымалары экспрессиясеннән (GTEx). Прогностик билге модельләрен төзү өчен өстәмә унивариат һәм лассо регрессия анализлары үткәрелде. Аннары без кәкре астындагы мәйданны исәпләдек һәм югары һәм түбән куркынычлы ашказаны асты бизе аденокарциномасы булган пациентларны ачыклау өчен оптималь чик кыйммәтен билгеләдек. Югары һәм түбән куркынычлы ашказаны асты бизе яман шеше булган пациентларда клиник үзенчәлекләрне, иммун күзәнәкләре инфильтрациясен, иммуносупрессив микротирәлекне һәм химиотерапиягә каршы торучанлыкны чагыштыру өчен.
Без 20 DEirlncRNA парын ачыкладык һәм пациентларны оптималь чикләү кыйммәтенә карап төркемләдек. Без прогностик имза моделебезнең PAAD белән авыручыларның фаразын фаразлауда сизелерлек нәтиҗәләргә ия булуын күрсәттек. ROC кәкресенең AUC 1 еллык фараз өчен 0,905, 2 еллык фараз өчен 0,942 һәм 3 еллык фараз өчен 0,966 тәшкил итә. Югары куркынычлы пациентларның яшәү күрсәткечләре түбәнрәк һәм клиник үзенчәлекләре начаррак булган. Без шулай ук югары куркынычлы пациентларның иммуносупрессияләнгән булуын һәм иммунотерапиягә каршы торучанлык үстерергә мөмкинлеген күрсәттек. Хисаплау фаразлау коралларына нигезләнеп, паклитаксел, сорафениб һәм эрлотиниб кебек яман шешкә каршы препаратларны бәяләү PAAD белән авыручы югары куркынычлы пациентлар өчен урынлы булырга мөмкин.
Гомумән алганда, безнең тикшеренү парлы irlncRNA нигезендә яңа прогностик куркыныч моделен булдырды, ул ашказаны асты бизе яман шеше белән авыручыларда өметле прогностик кыйммәт күрсәтте. Безнең прогностик куркыныч моделе медицина дәвалавы өчен яраклы PAAD белән авыручыларны аерырга ярдәм итә ала.
Ашказаны асты бизе яман шеше - биш еллык яшәү күрсәткече түбән һәм югары дәрәҗәдә булган яман шеш. Диагноз куелган вакытта күпчелек пациентлар инде алга киткән стадияләрдә була. COVID-19 эпидемиясе шартларында табиблар һәм шәфкать туташлары ашказаны асты бизе яман шеше белән авыручыларны дәвалаганда зур басым астында калалар, һәм пациентларның гаиләләре дә дәвалау карарларын кабул иткәндә күпсанлы басымга дучар булалар [1, 2]. Неоадъювант терапия, хирургик резекция, нур терапиясе, химиотерапия, максатчан молекуляр терапия һәм иммун тикшерү ноктасы ингибиторлары (ICI) кебек DOADларны дәвалауда зур казанышлар булса да, пациентларның якынча 9% ы диагноз куелганнан соң биш ел исән кала [3]. ], 4]. Ашказаны асты бизе аденокарциномасының иртә симптомнары атипик булганлыктан, пациентларга гадәттә алга киткән стадиядә метастазлар диагнозы куела [5]. Шуңа күрә, билгеле бер пациент өчен, шәхси комплекс дәвалау барлык дәвалау вариантларының өстенлекләрен һәм кимчелекләрен чагыштырырга тиеш, яшәүне озайту өчен генә түгел, ә тормыш сыйфатын яхшырту өчен дә [6]. Шуңа күрә пациентның фаразын төгәл бәяләү өчен нәтиҗәле фаразлау моделе кирәк [7]. Шулай итеп, PAAD белән авыручыларның исән калуын һәм тормыш сыйфатын тигезләү өчен тиешле дәвалау сайларга мөмкин.
ПААДның начар фаразы, нигездә, химиотерапия препаратларына чыдамлылык белән бәйле. Соңгы елларда иммун тикшерү ноктасы ингибиторлары каты шешләрне дәвалауда киң кулланыла [8]. Ләкин ашказаны асты бизе яман шешендә ИКИ куллану сирәк кенә уңышлы була [9]. Шуңа күрә ИКИ терапиясеннән файда күрергә мөмкин булган пациентларны ачыклау мөһим.
Озын кодланмаган РНК (lncRNA) - 200 нуклеотидтан артык транскриптлы кодланмаган РНК төре. LncRNAлар киң таралган һәм кеше транскриптомының якынча 80% ын тәшкил итә [10]. Күп санлы эшләр lncRNA нигезендәге прогностик модельләрнең пациентның фаразын нәтиҗәле фаразлый алуын күрсәтте [11, 12]. Мәсәлән, күкрәк яман шешендә прогностик имзалар булдыру өчен 18 аутофагия белән бәйле lncRNA ачыкланды [13]. Глиоманың прогностик үзенчәлекләрен билгеләү өчен тагын алты иммун белән бәйле lncRNA кулланылды [14].
Ашказаны асты бизе яман шешендә кайбер тикшеренүләр пациентның фаразын фаразлау өчен lncRNA нигезендәге имзаларны билгеләде. Ашказаны асты бизе аденокарциномасында ROC кәкресе астындагы мәйдан (AUC) нибары 0,742 һәм гомуми яшәү вакыты (OS) 3 ел булган 3-lncRNA имзасы билгеләнде [15]. Моннан тыш, lncRNA экспрессия кыйммәтләре төрле геномнарда, төрле мәгълүмат форматларында һәм төрле пациентларда төрлечә була, һәм фаразлау моделенең эшчәнлеге тотрыксыз. Шуңа күрә, без иммунитетка бәйле lncRNA (irlncRNA) имзаларын булдыру өчен яңа модельләштерү алгоритмын, парлаштыруны һәм итерацияне кулланабыз, бу төгәлрәк һәм тотрыклырак фаразлау моделен булдырырга ярдәм итә [8].
Нормализацияләнгән RNAseq мәгълүматлары (FPKM) һәм клиник ашказаны асты бизе яман шешенең TCGA һәм генотип тукымаларының экспрессиясе (GTEx) мәгълүматлары UCSC XENA мәгълүматлар базасыннан алынды (http://xenabrowser.net/datapages/). GTF файллары Ensembl мәгълүматлар базасыннан алынды (http://asia.ensembl.org) һәм RNAseqтан lncRNA экспрессиясе профильләрен алу өчен кулланылды. Без ImmPort мәгълүматлар базасыннан (http://www.immport.org) иммунитетка бәйле геннарны йөкләдек һәм корреляция анализы ярдәмендә иммунитетка бәйле lncRNAларны (irlncRNA) ачыкладык (p < 0.001, r > 0.4). TCGA-PAAD когортасында (|logFC| > 1 һәм FDR) <0.05) GEPIA2 мәгълүматлар базасыннан (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) алынган irlncRNAларны һәм дифференциаль экспрессияләнгән lncRNAларны кисештерү юлы белән дифференциаль экспрессияләнгән irlncRNAларны (DEirlncRNAлар) ачыклау.
Бу ысул турында элегрәк хәбәр ителгән иде [8]. Аерым алганда, без парлы lncRNA A һәм lncRNA B ны алыштыру өчен X төзибез. lncRNA A экспрессия кыйммәте lncRNA B экспрессия кыйммәтеннән югарырак булганда, X 1 дип билгеләнә, югыйсә X 0 дип билгеләнә. Шуңа күрә без 0 яки – 1 матрицасын ала алабыз. Матрицаның вертикаль күчәре һәр үрнәкне, ә горизонталь күчәре 0 яки 1 кыйммәте булган һәр DEirlncRNA парын күрсәтә.
Прогностик DEirlncRNA парларын тикшерү өчен бер үзгәрүчәнле регрессия анализы, аннары Лассо регрессиясе кулланылды. Лассо регрессия анализында 1000 тапкыр кабатланган 10 тапкыр кросс-валидация кулланылды (p < 0,05), һәр йөгерүдә 1000 очраклы стимул. Һәр DEirlncRNA парының ешлыгы 1000 циклда 100 тапкырдан артып киткәч, прогностик куркыныч моделен төзү өчен DEirlncRNA парлары сайланды. Аннары без PAAD пациентларын югары һәм түбән куркыныч төркемнәренә бүлү өчен оптималь чик кыйммәтен табу өчен AUC кәкресен кулландык. Һәр модельнең AUC кыйммәте дә исәпләнде һәм кәкре рәвешендә сызылды. Әгәр кәкре максималь AUC кыйммәтен күрсәтүче иң югары ноктага җитсә, исәпләү процессы туктала һәм модель иң яхшы кандидат дип санала. 1, 3 һәм 5 еллык ROC кәкре модельләре төзелде. Прогностик куркыныч моделенең бәйсез фаразлау эшчәнлеген тикшерү өчен бер үзгәрүчәнле һәм күп үзгәрүчәнле регрессия анализлары кулланылды.
Иммун күзәнәкләренең инфильтрация тизлеген өйрәнү өчен җиде корал кулланыгыз, шул исәптән XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS һәм CIBERSORT. Иммун күзәнәкләренең инфильтрациясе турында мәгълүматлар TIMER2 мәгълүматлар базасыннан күчереп алынды (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). Төзелгән модельнең югары һәм түбән куркыныч төркемнәре арасындагы иммун-инфильтрацияләүче күзәнәкләрнең эчтәлегендәге аерма Wilcoxon имзаланган дәрәҗә тесты ярдәмендә анализланды, нәтиҗәләр квадрат графикта күрсәтелгән. Куркыныч баллы кыйммәтләре һәм иммун-инфильтрацияләүче күзәнәкләр арасындагы бәйләнешне анализлау өчен Spearman корреляция анализы үткәрелде. Нәтиҗәдә алынган корреляция коэффициенты леди-аппос рәвешендә күрсәтелә. Әһәмиятлелек чигәсе p < 0,05 итеп билгеләнде. Процедура R пакеты ggplot2 кулланып башкарылды. Иммун күзәнәкләренең инфильтрация тизлеге белән бәйле модель һәм ген экспрессиясе дәрәҗәләре арасындагы бәйләнешне тикшерү өчен без ggstatsplot пакетын һәм скрипка графигын визуализацияләдек.
Ашказаны асты бизе яман шешен клиник дәвалау үрнәкләрен бәяләү өчен, без TCGA-PAAD когортасында еш кулланыла торган химиотерапия препаратларының IC50 исәпләдек. Югары һәм түбән куркыныч төркемнәре арасындагы ярты ингибитор концентрацияләрендәге (IC50) аермалар Wilcoxon имзаланган ранг тесты ярдәмендә чагыштырылды, һәм нәтиҗәләр R'да pRRethetic һәм ggplot2 кулланып төзелгән графиклар рәвешендә күрсәтелә. Барлык ысуллар да тиешле күрсәтмәләргә һәм нормаларга туры килә.
Безнең тикшеренүнең эш процессы 1 нче рәсемдә күрсәтелгән. lncRNA һәм иммунитет белән бәйле геннар арасындагы корреляция анализын кулланып, без p < 0,01 һәм r > 0,4 булган 724 irlncRNA сайладык. Аннары без GEPIA2-нең дифференциаль рәвештә экспрессияләнгән lncRNA-ларын анализладык (2А рәсем). Ашказаны асты бизе аденокарциномасы һәм нормаль ашказаны асты бизе тукымасы (|logFC| > 1, FDR < 0,05) арасында барлыгы 223 irlncRNA дифференциаль рәвештә экспрессияләнде, алар DEirlncRNA-лар дип атала.
Фаразлау куркынычы модельләрен төзү. (A) Дифференциаль рәвештә экспрессияләнгән lncRNAларның вулкан графигы. (B) 20 DEirlncRNA парлары өчен лассо коэффициентларының бүленеше. (C) LASSO коэффициенты бүленешенең өлешчә ихтималлык дисперсиясе. (D) 20 DEirlncRNA парларының бер үзгәрүчәнле регрессия анализын күрсәтүче урман графигы.
Аннары без 223 DEirlncRNA парларын парлаштырып, 0 яки 1 матрицасын төзедек. Барлыгы 13 687 DEirlncRNA пары ачыкланды. Бер үзгәрүчәнле һәм лассо регрессия анализыннан соң, ниһаять, 20 DEirlncRNA пары прогностик куркыныч моделен төзү өчен сыналды (2B-D рәсем). Лассо һәм күп регрессия анализы нәтиҗәләренә нигезләнеп, без TCGA-PAAD когортасындагы һәр пациент өчен куркыныч баллын исәпләдек (1 нче таблица). Лассо регрессия анализы нәтиҗәләренә нигезләнеп, без TCGA-PAAD когортасындагы һәр пациент өчен куркыныч баллын исәпләдек. ROC кәкресенең AUC 1 еллык куркыныч моделе фаразы өчен 0,905, 2 еллык фараз өчен 0,942 һәм 3 еллык фараз өчен 0,966 тәшкил итте (3A-B рәсем). Без 3,105 оптималь чик кыйммәтен билгеләдек, TCGA-PAAD когорта пациентларын югары һәм түбән куркыныч төркемнәренә бүлдек, һәм һәр пациент өчен яшәү нәтиҗәләрен һәм куркыныч баллы бүленешен график буенча күрсәттек (3C-E рәсем). Каплан-Мейер анализы күрсәткәнчә, югары куркыныч төркемендәге PAAD пациентларының яшәү дәрәҗәсе түбән куркыныч төркемендәге пациентларга караганда күпкә түбәнрәк (p < 0,001) (3F рәсем).
Прогностик куркыныч модельләренең дөреслеге. (A) Прогностик куркыныч моделенең ROC. (B) 1, 2 һәм 3 еллык ROC прогностик куркыныч модельләре. (C) Прогностик куркыныч моделенең ROC. Оптималь чик ноктасын күрсәтә. (DE) Яшәү статусы (D) һәм куркыныч баллары (E) бүленеше. (F) Югары һәм түбән куркыныч төркемнәрендәге PAAD пациентларының Каплан-Мейер анализы.
Без клиник үзенчәлекләр буенча куркыныч балларындагы аермаларны өстәмә рәвештә бәяләдек. Диаграмма (4А рәсем) клиник үзенчәлекләр һәм куркыныч баллары арасындагы гомуми бәйләнешне күрсәтә. Аерым алганда, өлкәнрәк пациентларда куркыныч баллары югарырак булган (4В рәсем). Моннан тыш, II стадияле пациентларда I стадияле пациентларга караганда куркыныч баллары югарырак булган (4С рәсем). PAAD пациентларында шеш дәрәҗәсенә килгәндә, 3 нче дәрәҗәдәге пациентларда куркыныч баллары 1 һәм 2 нче дәрәҗәдәге пациентларга караганда югарырак булган (4D рәсем). Без шулай ук бер үзгәрүчәнле һәм күп үзгәрүчәнле регрессия анализларын үткәрдек һәм PAAD пациентларында куркыныч баллы (p < 0,001) һәм яшь (p = 0,045) бәйсез прогностик факторлар булуын күрсәттек (5А-В рәсем). ROC кәкресе PAAD пациентларының 1, 2 һәм 3 еллык яшәү вакытын фаразлауда куркыныч баллы башка клиник үзенчәлекләргә караганда өстенрәк булуын күрсәтте (5С-Е рәсем).
Прогностик куркыныч модельләренең клиник үзенчәлекләре. Гистограмма (А) TCGA-PAAD когортасындагы пациентларның (B) яшен, (C) шеш стадиясен, (D) шеш дәрәҗәсен, куркыныч баллын һәм җенесен күрсәтә. **p < 0.01
Прогностик куркыныч модельләренең бәйсез фаразлау анализы. (AB) Прогностик куркыныч модельләренең һәм клиник үзенчәлекләренең бер үзгәрүчәнле (A) һәм күп үзгәрүчәнле (B) регрессия анализлары. (CE) Прогностик куркыныч модельләре һәм клиник үзенчәлекләр өчен 1, 2 һәм 3 еллык ROC
Шуңа күрә без вакыт һәм куркыныч балллары арасындагы бәйләнешне тикшердек. Без PAAD пациентларында куркыныч баллының CD8+ T күзәнәкләре һәм NK күзәнәкләре белән кире корреляцияләнгәнен ачыкладык (6А рәсем), бу югары куркыныч төркемендә иммун функциясенең басылуын күрсәтә. Без шулай ук югары һәм түбән куркыныч төркемнәре арасында иммун күзәнәкләре инфильтрациясендәге аерманы бәяләдек һәм шул ук нәтиҗәләрне таптык (7 рәсем). Югары куркыныч төркемендә CD8+ T күзәнәкләре һәм NK күзәнәкләре азрак инфильтрацияләнде. Соңгы елларда каты шешләрне дәвалауда иммун тикшерү ноктасы ингибиторлары (ICI) киң кулланыла. Ләкин ашказаны асты бизе яман шешендә ICI куллану сирәк кенә уңышлы булды. Шуңа күрә без югары һәм түбән куркыныч төркемнәрендә иммун тикшерү ноктасы геннарының экспрессиясен бәяләдек. Без түбән куркыныч төркемендә CTLA-4 һәм CD161 (KLRB1) артык экспрессияләнгәнен ачыкладык (6B-G рәсем), бу түбән куркыныч төркемендәге PAAD пациентларының ICIга сизгер булырга мөмкинлеген күрсәтә.
Прогностик куркыныч моделе һәм иммун күзәнәкләре инфильтрациясенең корреляция анализы. (A) Прогностик куркыныч моделе һәм иммун күзәнәкләре инфильтрациясе арасындагы корреляция. (BG) Югары һәм түбән куркыныч төркемнәрендә ген экспрессиясен күрсәтә. (HK) Югары һәм түбән куркыныч төркемнәрендә специфик яман шешкә каршы препаратлар өчен IC50 кыйммәтләре. *p < 0.05, **p < 0.01, ns = әһәмиятле түгел
Без TCGA-PAAD когортасында куркыныч балллары һәм гадәти химиотерапия препаратлары арасындагы бәйләнешне бәяләдек. Без ашказаны асты бизе яман шешендә еш кулланыла торган яман шешкә каршы препаратларны эзләдек һәм югары һәм түбән куркыныч төркемнәре арасында аларның IC50 кыйммәтләрендәге аермаларны анализладык. Нәтиҗәләр күрсәткәнчә, AZD.2281 (олапариб) IC50 кыйммәте югары куркыныч төркемендә югарырак булган, бу югары куркыныч төркемендәге PAAD пациентларының AZD.2281 дәвалавына чыдам булырга мөмкинлеген күрсәтә (6H рәсем). Моннан тыш, югары куркыныч төркемендә паклитаксел, сорафениб һәм эрлотинибның IC50 кыйммәтләре түбәнрәк булган (6I-K рәсем). Без югары куркыныч төркемендә югары IC50 кыйммәтләре югары булган 34 яман шешкә каршы препаратны һәм югары куркыныч төркемендә түбәнрәк IC50 кыйммәтләре булган 34 яман шешкә каршы препаратны ачыкладык (2 нче таблица).
lncRNA, mRNA һәм miRNA киң таралган булуын һәм яман шеш үсешендә мөһим роль уйнавын инкарь итеп булмый. Берничә төр яман шеш авыруында гомуми яшәүне фаразлауда mRNA яки miRNAның мөһим ролен раслаучы күп дәлилләр бар. Шиксез, күп кенә прогностик куркыныч модельләре дә lncRNAларга нигезләнгән. Мәсәлән, Луо һ.б. Тикшеренүләр LINC01094нең PC пролиферациясендә һәм метастазында төп роль уйнавын күрсәтте, һәм LINC01094нең югары экспрессиясе ашказаны асты бизе яман шеше белән авыручыларның яшәү дәрәҗәсенең начар булуын күрсәтә [16]. Лин һ.б. тәкъдим иткән тикшеренү lncRNA FLVCR1-AS1ның түбәнәюе ашказаны асты бизе яман шеше белән авыручыларда начар фараз белән бәйле булуын күрсәтте [17]. Ләкин иммунитет белән бәйле lncRNAлар яман шеш белән авыручыларның гомуми яшәү дәрәҗәсен фаразлау ягыннан чагыштырмача азрак тикшерелә. Соңгы вакытта яман шеш белән авыручыларның яшәү дәрәҗәсен фаразлау һәм шуның белән дәвалау ысулларын көйләү өчен прогностик куркыныч модельләрен төзүгә зур эш юнәлтелгән [18, 19, 20]. Яман шеш башлануында, үсешендә һәм химиотерапия кебек дәвалауларга җавап бирүдә иммун инфильтратларының мөһим ролен тану арта бара. Күп санлы тикшеренүләр шешкә үтеп керүче иммун күзәнәкләрнең цитотоксик химиотерапиягә җавап бирүдә мөһим роль уйнавын раслады [21, 22, 23]. Шешнең иммун микротирәлеге шеш пациентларының исән калуында мөһим фактор булып тора [24, 25]. Иммунотерапия, бигрәк тә ICI терапиясе, каты шешләрне дәвалауда киң кулланыла [26]. Иммун белән бәйле геннар прогностик куркыныч модельләрен төзү өчен киң кулланыла. Мәсәлән, Су һ.б. Иммун белән бәйле прогностик куркыныч моделе аналык яман шеше пациентларының прогнозын фаразлау өчен аксым кодлаучы геннарга нигезләнгән [27]. lncRNA кебек кодланмаган геннар да прогностик куркыныч модельләрен төзү өчен яраклы [28, 29, 30]. Луо һ.б. дүрт иммун белән бәйле lncRNAны сынап карадылар һәм муен яман шеше куркынычы өчен фаразлау моделен төзеделәр [31]. Хан һ.б. Барлыгы 32 дифференциаль рәвештә экспрессияләнгән транскрипт ачыкланды, һәм шуңа нигезләнеп, 5 әһәмиятле транскрипт белән фаразлау моделе төзелде, ул бөер трансплантациясеннән соң биопсия белән расланган кискен кире кагуны фаразлау өчен бик тәкъдим ителгән корал буларак тәкъдим ителде [32].
Бу модельләрнең күбесе ген экспрессиясе дәрәҗәләренә нигезләнгән, я аксым кодлаучы геннар, я кодламаучы геннар. Ләкин бер үк ген төрле геномнарда, мәгълүмат форматларында һәм төрле пациентларда төрле экспрессия кыйммәтләренә ия булырга мөмкин, бу фаразлау модельләрендә тотрыксыз бәяләүләргә китерә. Бу тикшеренүдә без төгәл экспрессия кыйммәтләреннән бәйсез рәвештә ике пар lncRNA белән акыллы модель төзедек.
Бу тикшеренүдә без иммунитет белән бәйле геннар белән корреляция анализы аша беренче тапкыр irlncRNA ачыкладык. Без 223 DEirlncRNAны дифференциаль рәвештә экспрессияләнгән lncRNAлар белән гибридизацияләү юлы белән тикшердек. Икенчедән, без бастырылган DEirlncRNA парлаштыру ысулына [31] нигезләнеп 0 яки 1 матрицасын төзедек. Аннары без прогностик DEirlncRNA парларын ачыклау һәм фаразлау куркыныч моделен төзү өчен бер үзгәрүчәнле һәм лассо регрессия анализларын үткәрдек. Без PAAD белән авыручыларда куркыныч баллары һәм клиник үзенчәлекләр арасындагы бәйләнешне анализладык. Без безнең прогностик куркыныч моделенең, PAAD пациентларында мөстәкыйль прогностик фактор буларак, югары дәрәҗәдәге пациентларны түбән дәрәҗәдәге пациентлардан һәм югары дәрәҗәдәге пациентларны түбән дәрәҗәдәге пациентлардан нәтиҗәле аера алуын ачыкладык. Моннан тыш, прогностик куркыныч моделенең ROC кәкресенең AUC кыйммәтләре 1 еллык фараз өчен 0,905, 2 еллык фараз өчен 0,942 һәм 3 еллык фараз өчен 0,966 тәшкил итте.
Тикшеренүчеләр CD8+ Т күзәнәкләренең югарырак инфильтрациясе булган пациентларның ICI дәвалавына сизгеррәк булуларын хәбәр иттеләр [33]. Шеш иммун микротирәлегендә цитотоксик күзәнәкләр, CD56 NK күзәнәкләре, NK күзәнәкләре һәм CD8+ Т күзәнәкләре күләменең артуы шешне бастыручы эффектның бер сәбәбе булырга мөмкин [34]. Элегерәк үткәрелгән тикшеренүләр күрсәткәнчә, шешкә инфильтрацияләүче CD4(+) T һәм CD8(+) T дәрәҗәләренең югарырак булуы озак яшәү белән бәйле [35]. CD8 Т күзәнәкләренең начар инфильтрациясе, неоантигеннарның түбән йөкләнеше һәм югары иммуносупрессив шеш микротирәлеге ICI терапиясенә җавап бирмәүгә китерә [36]. Без куркыныч баллының CD8+ Т күзәнәкләре һәм NK күзәнәкләре белән тискәре корреляциядә булуын ачыкладык, бу югары куркыныч баллы булган пациентларның ICI дәвалавына яраклы булмаска һәм начаррак фаразларга ия булырга мөмкинлеген күрсәтә.
CD161 - табигый киллер (NK) күзәнәкләренең маркеры. CD8+CD161+ CAR белән трансдукцияләнгән Т күзәнәкләре HER2+ ашказаны асты бизенең канал аденокарциномасы ксенотрансплантат модельләрендә in vivo шешкә каршы нәтиҗәлелекне арттыра [37]. Иммун контроль ноктасы ингибиторлары цитотоксик Т лимфоцитлары белән бәйле аксым 4 (CTLA-4) һәм программалаштырылган күзәнәк үлеме аксымы 1 (PD-1) / программалаштырылган күзәнәк үлеме лиганды 1 (PD-L1) юлларына юнәлтелгән һәм күп өлкәләрдә зур потенциалга ия. CTLA-4 һәм CD161 (KLRB1) экспрессиясе югары куркыныч төркемнәрендә түбәнрәк, бу югары куркыныч балллары булган пациентларның ICI дәвалавына хокуклы булмаска мөмкинлеген тагын бер кат күрсәтә. [38]
Югары куркынычлы пациентлар өчен яраклы дәвалау вариантларын табу өчен, без төрле яман шешкә каршы препаратларны анализладык һәм PAAD белән авыручыларда киң кулланыла торган паклитаксел, сорафениб һәм эрлотинибның PAAD белән авыручылар өчен яраклы булырга мөмкинлеген ачыкладык. [33]. Чжан һ.б. теләсә нинди ДНК зыяны (DDR) юлындагы мутацияләр простата яман шеше белән авыручыларда начар фаразга китерергә мөмкин икәнен ачыкладылар [39]. Ашказаны асты бизе рагы Olaparib Ongoing (POLO) тикшеренүе күрсәткәнчә, олапариб белән дәвалау ашказаны асты бизе каналы аденокарциномасы һәм BRCA1/2 гермаль мутацияләре булган пациентларда беренче линия платина нигезендәге химиотерапиядән соң плацебо белән чагыштырганда прогрессиясез яшәүне озайта [40]. Бу пациентларның бу төркемчәсендә дәвалау нәтиҗәләренең сизелерлек яхшыруына зур оптимизм бирә. Бу тикшеренүдә AZD.2281 (олапариб) IC50 кыйммәте югары куркынычлы төркемдә югарырак булган, бу югары куркынычлы төркемдәге PAAD пациентларының AZD.2281 белән дәвалауга чыдам булырга мөмкинлеген күрсәтә.
Бу тикшеренүдәге фаразлау модельләре яхшы фаразлау нәтиҗәләре бирә, ләкин алар аналитик фаразларга нигезләнгән. Бу нәтиҗәләрне клиник мәгълүматлар белән ничек расларга - мөһим сорау. Эндоскопик нечкә энә аспирациясе УЗИ (EUS-FNA) каты һәм экстрапанкреатик ашказаны асты бизе зарарлануларын диагностикалау өчен алыштыргысыз ысулга әйләнде, сизгерлеге 85% һәм спецификлыгы 98% [41]. EUS нечкә энәле биопсия (EUS-FNB) энәләренең барлыкка килүе, нигездә, FNAга караганда югарырак диагностик төгәллек, гистологик структураны саклый торган үрнәкләр алу һәм шулай итеп билгеле бер диагнозлар өчен мөһим булган иммун тукымалар булдыру кебек сизелә торган өстенлекләргә нигезләнгән. махсус буяу [42]. Әдәбиятка системалы күзәтү FNB энәләренең (бигрәк тә 22G) ашказаны асты бизе массаларыннан тукымалар алуда иң югары нәтиҗәлелекне күрсәтүен раслады [43]. Клиник яктан, радикаль хирургиягә аз санлы пациентлар гына хокуклы, һәм күпчелек пациентларда башлангыч диагноз вакытында операция ясалмый торган шешләр бар. Клиник практикада, пациентларның аз өлеше генә радикаль хирургиягә яраклы, чөнки күпчелек пациентларда башлангыч диагноз вакытында операция ясалмый торган шешләр бар. EUS-FNB һәм башка ысуллар белән патологик раслаудан соң, гадәттә, химиотерапия кебек стандартлаштырылган хирургик булмаган дәвалау ысулы сайлана. Безнең аннан соңгы тикшеренү программабыз - бу тикшеренүнең прогностик моделен ретроспектив анализ аша хирургик һәм хирургик булмаган когорталарда сынап карау.
Гомумән алганда, безнең тикшеренү парлы irlncRNA нигезендә яңа прогностик куркыныч моделен булдырды, ул ашказаны асты бизе яман шеше белән авыручыларда өметле прогностик кыйммәт күрсәтте. Безнең прогностик куркыныч моделе медицина дәвалавы өчен яраклы PAAD белән авыручыларны аерырга ярдәм итә ала.
Агымдагы тикшеренүдә кулланылган һәм анализланган мәгълүмат җыелмалары тиешле автордан акылга сыярлык сорау буенча алырга мөмкин.
Суй Вэнь, Гун X, Чжуан Y. COVID-19 пандемиясе вакытында тискәре хисләрне эмоциональ җайга салуда үз-үзеңә ышанычның арадашчы роле: кисемтәле тикшеренү. Int J Ment Health Nurs [журнал мәкаләсе]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Суй Вэн, Гун Х, Цяо Х, Чжан Л, Ченг Дж, Донг Дж һ.б. Гаилә әгъзаларының интенсив терапия бүлекләрендә альтернатив карарлар кабул итүгә карашлары: системалы күзәтү. INT J NURS STUD [журнал мәкаләсе; күзәтү]. 2023 01/01/2023;137:104391.
Винсент А, Герман Дж, Шулих Р, Хрубан Р.Х., Гоггинс М. Ашказаны асты бизе яман шеше. Ланцет. [Журнал мәкаләсе; тикшеренүләргә ярдәм, NIH, читтән торып уку; тикшеренүләргә ярдәм, АКШтан читтәге хөкүмәт; күзәтү]. 2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ильич М, Ильич И. Ашказаны асты бизе яман шешенең эпидемиологиясе. Бөтендөнья гастроэнтерология журналы. [Журнал мәкаләсе, күзәтү]. 2016 28.11.2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Ашказаны асты бизе яман шеше белән авыручыларның гомуми яшәү вакытын фаразлау өчен яңа tp53 белән бәйле номограмма. BMC Cancer [журнал мәкаләсе]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Химиотерапия алучы колоректаль яман шеш авыруларында яман шеш белән бәйле арыганлыкка эремәгә юнәлтелгән терапиянең йогынтысы: очраклы контрольдә тотылган тикшеренү. Онкологик шәфкать туташы. [Журнал мәкаләсе; очраклы контрольдә тотылган тикшеренү; тикшеренү АКШтан читтәге хөкүмәт тарафыннан хуплана]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Чжан Ченг, Чжэн Вен, Лу Й, Шан Л, Сюй Донг, Пан Й һ.б. Операциядән соңгы карциноэмбрион антиген (CEA) дәрәҗәләре нормаль операциягә кадәрге CEA дәрәҗәләре булган пациентларда колоректаль яман шеш резекциясеннән соң нәтиҗәне фаразлый. Трансляцияле яман шеш тикшеренүләре үзәге. [Журнал мәкаләсе]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Хун Вэнь, Лян Ли, Гу Ю, Ци Зи, Цю Хуа, Янг С һ.б. Иммунитет белән бәйле lncRNAлар яңа билгеләрне барлыкка китерә һәм кеше бавыр клеткалы карциномасының иммун ландшафтын фаразлый. Молекуляр нуклеин кислоталары [Журнал мәкаләсе]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Тоффи Р.Дж., Чжу Ю., Шулих Р.Д. Ашказаны асты бизе яман шешен иммунотерапияләү: киртәләре һәм ачышлары. Энн Гастроинтестиналь хирург [Журнал мәкаләсе; күзәтү]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Халл Р., Мбита З., Дламини З. Озын кодланмаган РНКлар (LncRNA), вируслы шеш геномикасы һәм аберрант сплайсинг вакыйгалары: терапевтик нәтиҗәләр. AM J CANCER RES [журнал мәкаләсе; күзәтү]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Ван Дж, Чен П, Чжан Й, Дин Дж, Ян Й, Ли Х. 11-Эндометрия яман шеше фаразлары белән бәйле lncRNA имзаларын идентификацияләү. Фән казанышлары [журнал мәкаләсе]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Цзян С, Рен Х, Лю С, Лу З, Сюй А, Цин С һ.б. Папилляр күзәнәкле бөер карциномасында РНК белән бәйләнгән аксым прогностик геннарның һәм дару кандидатларының комплекслы анализы. преген. [Журнал мәкаләсе]. 2021 01/20/2021;12:627508.
Ли Х, Чен Дж, Ю К, Хуан Х, Лю З, Ван Х һ.б. Аутофагия белән бәйле озын кодланмаган РНК үзенчәлекләре күкрәк яман шеше фаразын фаразлый. преген. [Журнал мәкаләсе]. 2021 01/20/2021;12:569318.
Чжоу М, Чжан З, Чжао Х, Бао С, Ченг Л, Сун Дж. Иммун белән бәйле алты lncRNA имзасы глиобластома мультиформасында фаразны яхшырта. MOL нейробиологиясе. [Журнал мәкаләсе]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Ву Б, Ван К, Фэй Дж, Бао Й, Ван Х, Сонг З һ.б. Яңа три-lncRNA имзасы ашказаны асты бизе яман шеше белән авыручыларның исән калуын фаразлый. ONKOL ВӘКИЛЛӘРЕ. [Журнал мәкаләсе]. 2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Луо К, Лин К, Ху К, Чжу Х, Чжу Дж, Чжу З. LINC01094 губка белән капланган miR-577 аша LIN28B экспрессиясен һәм PI3K/AKT юлын көйләү юлы белән ашказаны асты бизе яман шешенең үсешен стимуллаштыра. Mol Therapeutics – Нуклеин кислоталары. 2021;26:523–35.
Лин Дж, Чжай Х, Зоу С, Сюй З, Чжан Дж, Цзян Л һ.б. lncRNA FLVCR1-AS1 һәм KLF10 арасындагы уңай кире элемтә PTEN/AKT юлы аша ашказаны асты бизе яман шешенең үсешен тоткарларга мөмкин. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Чжоу X, Лю X, Зенг X, Ву Д, Лю Л. Гепатоцеллюляр карциномада гомуми яшәүне фаразлаучы унөч генны ачыклау. Biosci Rep [журнал мәкаләсе]. 2021 04/09/2021.
Бастырып чыгару вакыты: 2023 елның 22 сентябре